定义上的区别：
从名字上来看，就能看出他们是有不同点的。不过他们的动力来源，都完全是依靠直流电动机(也可以叫马达)来驱动的。下面好好介绍下他们的工作原理。
工作原理上的区别：
磁力搅拌器的工作原理，从名字上来看，提到了磁力，磁力从那里还？当然是需要通过磁铁了。利用磁性物质同性相斥的特性，通过不断变换基座的两端的极性来推动磁性搅拌仔转动。使用于粘稠度不是很大的液体，或者固液混合物，利用了磁场和漩涡的原理。有些还是带加热功能的，满足实验中对温度的要求。
电动搅拌器的工作原理，是直流电动机<也可以叫马达>主轴带动搅拌刀来实现的，搅拌刀是直接安装在直流电机上的，不需要通过任何东西来进行传递，直接实现搅拌。
至于选择的什么样的搅拌器，应该从实际情况出发，粘稠度的大小，场地的大小，每次实验量的大小，从而来决定选择那种搅拌器。
参考资料：http://www.shsile.com/jishu/37.html
